Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDR1Q08345 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms