Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBQ06643 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBQ06643 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBQ06643 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBQ06643 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBQ06643 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBQ06643 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBQ06643 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBQ06643 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBQ06643 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBQ06643 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBQ06643 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBQ06643 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBQ06643 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBQ06643 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LTBQ06643 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBQ06643 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBQ06643 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBQ06643 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBQ06643 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBQ06643 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LTBQ06643 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LTBQ06643 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBQ06643 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBQ06643 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBQ06643 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBQ06643 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LTBQ06643 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LTBQ06643 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LTBQ06643 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms