Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABPAQ06546 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms