Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
ATP7AQ04656 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ATP7AQ04656 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7AQ04656 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7AQ04656 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ATP7AQ04656 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7AQ04656 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7AQ04656 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7AQ04656 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7AQ04656 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7AQ04656 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7AQ04656 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7AQ04656 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7AQ04656 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7AQ04656 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7AQ04656 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7AQ04656 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7AQ04656 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7AQ04656 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7AQ04656 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7AQ04656 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7AQ04656 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7AQ04656 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7AQ04656 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7AQ04656 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ATP7AQ04656 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP7AQ04656 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP7AQ04656 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP7AQ04656 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP7AQ04656 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP7AQ04656 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ATP7AQ04656 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP7AQ04656 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP7AQ04656 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP7AQ04656 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP7AQ04656 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ATP7AQ04656 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP7AQ04656 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP7AQ04656 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP7AQ04656 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP7AQ04656 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP7AQ04656 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP7AQ04656 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms