Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CACNB1Q02641 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 LYVE1-203ENST00000529598 936 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AC084824.3-201ENST00000620472 856 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AL133417.1-201ENST00000425290 688 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNB1Q02641 AC137794.1-201ENST00000509185 914 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms