Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRX1P78414 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRX1P78414 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRX1P78414 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRX1P78414 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRX1P78414 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRX1P78414 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRX1P78414 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRX1P78414 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRX1P78414 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
IRX1P78414 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRX1P78414 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRX1P78414 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRX1P78414 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRX1P78414 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRX1P78414 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRX1P78414 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRX1P78414 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
IRX1P78414 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRX1P78414 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRX1P78414 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRX1P78414 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRX1P78414 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRX1P78414 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRX1P78414 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRX1P78414 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRX1P78414 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRX1P78414 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRX1P78414 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRX1P78414 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRX1P78414 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRX1P78414 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRX1P78414 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRX1P78414 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRX1P78414 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRX1P78414 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRX1P78414 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRX1P78414 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRX1P78414 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRX1P78414 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRX1P78414 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRX1P78414 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRX1P78414 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRX1P78414 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRX1P78414 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRX1P78414 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRX1P78414 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRX1P78414 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRX1P78414 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRX1P78414 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRX1P78414 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms