Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACLYP53396 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACLYP53396 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACLYP53396 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACLYP53396 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACLYP53396 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACLYP53396 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACLYP53396 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACLYP53396 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ACLYP53396 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACLYP53396 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACLYP53396 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACLYP53396 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACLYP53396 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ACLYP53396 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACLYP53396 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ACLYP53396 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACLYP53396 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACLYP53396 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACLYP53396 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACLYP53396 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACLYP53396 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACLYP53396 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACLYP53396 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACLYP53396 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACLYP53396 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACLYP53396 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACLYP53396 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACLYP53396 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACLYP53396 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACLYP53396 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACLYP53396 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACLYP53396 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACLYP53396 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACLYP53396 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACLYP53396 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACLYP53396 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACLYP53396 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACLYP53396 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACLYP53396 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACLYP53396 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACLYP53396 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACLYP53396 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACLYP53396 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACLYP53396 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACLYP53396 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACLYP53396 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACLYP53396 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACLYP53396 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACLYP53396 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACLYP53396 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACLYP53396 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACLYP53396 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACLYP53396 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ACLYP53396 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACLYP53396 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACLYP53396 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACLYP53396 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACLYP53396 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACLYP53396 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACLYP53396 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACLYP53396 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACLYP53396 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACLYP53396 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACLYP53396 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACLYP53396 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACLYP53396 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACLYP53396 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACLYP53396 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACLYP53396 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACLYP53396 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACLYP53396 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACLYP53396 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACLYP53396 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACLYP53396 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACLYP53396 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACLYP53396 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACLYP53396 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACLYP53396 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACLYP53396 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACLYP53396 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACLYP53396 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACLYP53396 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACLYP53396 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACLYP53396 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACLYP53396 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACLYP53396 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACLYP53396 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACLYP53396 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACLYP53396 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACLYP53396 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACLYP53396 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACLYP53396 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACLYP53396 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACLYP53396 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACLYP53396 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACLYP53396 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACLYP53396 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACLYP53396 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACLYP53396 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms