Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP98P52948 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP98P52948 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP98P52948 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP98P52948 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP98P52948 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP98P52948 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP98P52948 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP98P52948 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP98P52948 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP98P52948 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP98P52948 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP98P52948 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP98P52948 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP98P52948 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP98P52948 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP98P52948 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP98P52948 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP98P52948 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP98P52948 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP98P52948 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP98P52948 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP98P52948 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP98P52948 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP98P52948 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP98P52948 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP98P52948 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP98P52948 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP98P52948 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP98P52948 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP98P52948 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP98P52948 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP98P52948 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP98P52948 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP98P52948 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
NUP98P52948 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
NUP98P52948 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
NUP98P52948 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP98P52948 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP98P52948 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP98P52948 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP98P52948 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP98P52948 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP98P52948 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP98P52948 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP98P52948 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP98P52948 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP98P52948 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP98P52948 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP98P52948 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP98P52948 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP98P52948 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP98P52948 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP98P52948 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP98P52948 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP98P52948 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP98P52948 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP98P52948 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP98P52948 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP98P52948 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP98P52948 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP98P52948 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP98P52948 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP98P52948 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP98P52948 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP98P52948 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP98P52948 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP98P52948 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP98P52948 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP98P52948 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP98P52948 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP98P52948 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP98P52948 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP98P52948 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP98P52948 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP98P52948 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP98P52948 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP98P52948 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP98P52948 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP98P52948 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP98P52948 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP98P52948 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP98P52948 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP98P52948 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP98P52948 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP98P52948 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP98P52948 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP98P52948 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP98P52948 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP98P52948 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP98P52948 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP98P52948 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP98P52948 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP98P52948 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP98P52948 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP98P52948 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP98P52948 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP98P52948 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP98P52948 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP98P52948 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms