Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
SMARCA4P51532 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
SMARCA4P51532 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SMARCA4P51532 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms