Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC33■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC33■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC33■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms