Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK8P49336 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK8P49336 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK8P49336 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK8P49336 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK8P49336 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK8P49336 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK8P49336 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK8P49336 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK8P49336 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK8P49336 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK8P49336 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK8P49336 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK8P49336 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK8P49336 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK8P49336 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK8P49336 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK8P49336 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK8P49336 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK8P49336 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK8P49336 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK8P49336 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK8P49336 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK8P49336 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK8P49336 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK8P49336 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK8P49336 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK8P49336 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK8P49336 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK8P49336 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK8P49336 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK8P49336 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK8P49336 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK8P49336 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK8P49336 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK8P49336 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK8P49336 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK8P49336 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK8P49336 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK8P49336 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK8P49336 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK8P49336 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK8P49336 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK8P49336 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK8P49336 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK8P49336 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK8P49336 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK8P49336 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK8P49336 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK8P49336 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK8P49336 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK8P49336 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK8P49336 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK8P49336 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK8P49336 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK8P49336 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK8P49336 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK8P49336 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK8P49336 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK8P49336 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK8P49336 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK8P49336 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK8P49336 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK8P49336 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK8P49336 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK8P49336 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK8P49336 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK8P49336 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK8P49336 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK8P49336 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK8P49336 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK8P49336 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK8P49336 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK8P49336 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK8P49336 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK8P49336 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK8P49336 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK8P49336 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK8P49336 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK8P49336 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK8P49336 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK8P49336 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK8P49336 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK8P49336 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK8P49336 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK8P49336 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK8P49336 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK8P49336 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK8P49336 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK8P49336 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK8P49336 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK8P49336 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK8P49336 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK8P49336 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK8P49336 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK8P49336 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK8P49336 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK8P49336 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK8P49336 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK8P49336 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms