Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA4P35212 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA4P35212 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA4P35212 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA4P35212 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA4P35212 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA4P35212 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA4P35212 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA4P35212 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA4P35212 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA4P35212 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA4P35212 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA4P35212 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA4P35212 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA4P35212 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA4P35212 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA4P35212 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA4P35212 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA4P35212 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA4P35212 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA4P35212 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GJA4P35212 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GJA4P35212 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA4P35212 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA4P35212 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA4P35212 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA4P35212 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA4P35212 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA4P35212 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA4P35212 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA4P35212 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA4P35212 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA4P35212 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA4P35212 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA4P35212 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA4P35212 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA4P35212 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA4P35212 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA4P35212 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA4P35212 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA4P35212 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA4P35212 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA4P35212 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA4P35212 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA4P35212 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA4P35212 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA4P35212 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA4P35212 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA4P35212 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA4P35212 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA4P35212 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA4P35212 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA4P35212 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA4P35212 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJA4P35212 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA4P35212 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA4P35212 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA4P35212 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA4P35212 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA4P35212 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA4P35212 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA4P35212 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA4P35212 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA4P35212 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA4P35212 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA4P35212 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA4P35212 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA4P35212 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA4P35212 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA4P35212 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA4P35212 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA4P35212 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA4P35212 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA4P35212 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA4P35212 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA4P35212 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA4P35212 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA4P35212 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA4P35212 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA4P35212 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA4P35212 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA4P35212 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA4P35212 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA4P35212 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA4P35212 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA4P35212 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJA4P35212 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA4P35212 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA4P35212 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA4P35212 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA4P35212 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA4P35212 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA4P35212 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA4P35212 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA4P35212 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA4P35212 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA4P35212 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA4P35212 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA4P35212 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJA4P35212 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1099.1 ms