Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCKARP32238 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCKARP32238 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCKARP32238 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCKARP32238 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCKARP32238 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCKARP32238 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCKARP32238 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCKARP32238 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKARP32238 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKARP32238 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKARP32238 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKARP32238 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKARP32238 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKARP32238 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKARP32238 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKARP32238 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKARP32238 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKARP32238 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKARP32238 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKARP32238 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKARP32238 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKARP32238 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKARP32238 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKARP32238 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKARP32238 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKARP32238 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKARP32238 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKARP32238 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKARP32238 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKARP32238 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKARP32238 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKARP32238 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKARP32238 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKARP32238 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKARP32238 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKARP32238 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKARP32238 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKARP32238 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCKARP32238 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCKARP32238 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCKARP32238 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCKARP32238 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCKARP32238 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCKARP32238 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCKARP32238 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCKARP32238 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCKARP32238 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCKARP32238 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCKARP32238 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCKARP32238 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCKARP32238 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCKARP32238 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCKARP32238 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCKARP32238 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCKARP32238 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCKARP32238 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCKARP32238 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCKARP32238 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms