Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms