Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HMGB2P26583 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms