Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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