Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 CSNK1A1-209ENST00000606299 1075 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB1P14653 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB1P14653 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms