Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG2P13521 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCG2P13521 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCG2P13521 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG2P13521 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG2P13521 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG2P13521 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG2P13521 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG2P13521 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG2P13521 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG2P13521 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG2P13521 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG2P13521 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG2P13521 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG2P13521 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG2P13521 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG2P13521 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG2P13521 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG2P13521 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG2P13521 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG2P13521 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG2P13521 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG2P13521 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG2P13521 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG2P13521 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG2P13521 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG2P13521 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG2P13521 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG2P13521 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG2P13521 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG2P13521 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCG2P13521 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCG2P13521 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms