Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCF2P10911 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCF2P10911 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCF2P10911 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCF2P10911 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCF2P10911 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCF2P10911 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCF2P10911 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCF2P10911 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCF2P10911 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCF2P10911 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCF2P10911 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCF2P10911 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCF2P10911 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MCF2P10911 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCF2P10911 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCF2P10911 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCF2P10911 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCF2P10911 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCF2P10911 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCF2P10911 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCF2P10911 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCF2P10911 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCF2P10911 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MCF2P10911 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCF2P10911 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCF2P10911 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCF2P10911 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCF2P10911 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCF2P10911 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCF2P10911 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCF2P10911 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCF2P10911 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCF2P10911 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCF2P10911 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCF2P10911 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MCF2P10911 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCF2P10911 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MCF2P10911 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCF2P10911 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCF2P10911 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCF2P10911 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCF2P10911 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCF2P10911 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCF2P10911 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCF2P10911 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCF2P10911 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCF2P10911 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCF2P10911 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCF2P10911 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCF2P10911 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MCF2P10911 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MCF2P10911 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCF2P10911 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCF2P10911 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCF2P10911 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCF2P10911 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCF2P10911 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MCF2P10911 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCF2P10911 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCF2P10911 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCF2P10911 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCF2P10911 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCF2P10911 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCF2P10911 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCF2P10911 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCF2P10911 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCF2P10911 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCF2P10911 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCF2P10911 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCF2P10911 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCF2P10911 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCF2P10911 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCF2P10911 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCF2P10911 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCF2P10911 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCF2P10911 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MCF2P10911 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCF2P10911 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCF2P10911 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MCF2P10911 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCF2P10911 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCF2P10911 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCF2P10911 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCF2P10911 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCF2P10911 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCF2P10911 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCF2P10911 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2P10911 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2P10911 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2P10911 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2P10911 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2P10911 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2P10911 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2P10911 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2P10911 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2P10911 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2P10911 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2P10911 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCF2P10911 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms