Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMBP08118 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMBP08118 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMBP08118 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMBP08118 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMBP08118 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMBP08118 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMBP08118 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMBP08118 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMBP08118 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMBP08118 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMBP08118 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMBP08118 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMBP08118 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMBP08118 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMBP08118 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMBP08118 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMBP08118 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMBP08118 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMBP08118 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMBP08118 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMBP08118 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMBP08118 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMBP08118 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMBP08118 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMBP08118 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMBP08118 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMBP08118 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMBP08118 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MSMBP08118 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSMBP08118 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMBP08118 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMBP08118 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMBP08118 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMBP08118 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMBP08118 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMBP08118 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMBP08118 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMBP08118 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMBP08118 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMBP08118 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMBP08118 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMBP08118 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMBP08118 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMBP08118 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMBP08118 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMBP08118 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMBP08118 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMBP08118 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMBP08118 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMBP08118 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMBP08118 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMBP08118 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMBP08118 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMBP08118 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMBP08118 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMBP08118 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMBP08118 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMBP08118 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMBP08118 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSMBP08118 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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