Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms