Protein–RNA interactions for Protein: O43822

C21orf2, Protein C21orf2, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C21orf2O43822 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
C21orf2O43822 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C21orf2O43822 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms