Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF3O43395 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms