Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GNPATO15228 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GNPATO15228 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNPATO15228 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNPATO15228 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNPATO15228 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNPATO15228 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNPATO15228 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNPATO15228 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNPATO15228 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNPATO15228 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNPATO15228 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNPATO15228 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNPATO15228 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNPATO15228 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNPATO15228 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNPATO15228 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNPATO15228 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNPATO15228 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNPATO15228 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNPATO15228 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNPATO15228 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNPATO15228 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNPATO15228 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNPATO15228 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNPATO15228 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNPATO15228 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNPATO15228 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNPATO15228 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNPATO15228 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GNPATO15228 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNPATO15228 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNPATO15228 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GNPATO15228 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNPATO15228 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNPATO15228 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GNPATO15228 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GNPATO15228 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNPATO15228 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNPATO15228 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNPATO15228 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNPATO15228 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNPATO15228 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNPATO15228 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNPATO15228 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNPATO15228 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNPATO15228 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNPATO15228 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNPATO15228 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNPATO15228 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNPATO15228 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNPATO15228 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNPATO15228 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNPATO15228 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNPATO15228 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNPATO15228 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNPATO15228 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GNPATO15228 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNPATO15228 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPATO15228 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPATO15228 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPATO15228 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPATO15228 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPATO15228 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPATO15228 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPATO15228 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPATO15228 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPATO15228 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPATO15228 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPATO15228 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPATO15228 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPATO15228 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPATO15228 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPATO15228 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPATO15228 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPATO15228 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPATO15228 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPATO15228 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPATO15228 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPATO15228 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPATO15228 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPATO15228 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPATO15228 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPATO15228 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPATO15228 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPATO15228 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPATO15228 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNPATO15228 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNPATO15228 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNPATO15228 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNPATO15228 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNPATO15228 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNPATO15228 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNPATO15228 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNPATO15228 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNPATO15228 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNPATO15228 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNPATO15228 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNPATO15228 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GNPATO15228 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms