Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNMO15061 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNMO15061 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNMO15061 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNMO15061 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNMO15061 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNMO15061 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNMO15061 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNMO15061 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNMO15061 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNMO15061 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNMO15061 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNMO15061 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNMO15061 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNMO15061 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNMO15061 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNMO15061 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNMO15061 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNMO15061 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNMO15061 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNMO15061 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNMO15061 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNMO15061 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNMO15061 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNMO15061 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNMO15061 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNMO15061 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNMO15061 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNMO15061 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNMO15061 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNMO15061 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNMO15061 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNMO15061 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNMO15061 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNMO15061 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNMO15061 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNMO15061 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNMO15061 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNMO15061 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNMO15061 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNMO15061 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNMO15061 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNMO15061 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNMO15061 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNMO15061 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNMO15061 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNMO15061 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNMO15061 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNMO15061 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNMO15061 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNMO15061 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNMO15061 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNMO15061 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNMO15061 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNMO15061 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNMO15061 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNMO15061 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNMO15061 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SYNMO15061 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNMO15061 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNMO15061 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNMO15061 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNMO15061 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNMO15061 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNMO15061 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNMO15061 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNMO15061 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNMO15061 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNMO15061 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNMO15061 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNMO15061 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNMO15061 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNMO15061 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNMO15061 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNMO15061 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNMO15061 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNMO15061 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNMO15061 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNMO15061 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNMO15061 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNMO15061 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNMO15061 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNMO15061 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNMO15061 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNMO15061 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNMO15061 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNMO15061 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNMO15061 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNMO15061 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNMO15061 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNMO15061 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNMO15061 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNMO15061 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNMO15061 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNMO15061 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNMO15061 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNMO15061 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNMO15061 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNMO15061 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNMO15061 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms