Protein–RNA interactions for Protein: O14829

PPEF1, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPEF1O14829 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPEF1O14829 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPEF1O14829 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPEF1O14829 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPEF1O14829 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PPEF1O14829 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPEF1O14829 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPEF1O14829 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PPEF1O14829 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPEF1O14829 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPEF1O14829 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPEF1O14829 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PPEF1O14829 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PPEF1O14829 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPEF1O14829 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPEF1O14829 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPEF1O14829 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms