Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMB4A4D0S4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms