Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARP3Q9Y6F1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARP3Q9Y6F1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PARP3Q9Y6F1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PARP3Q9Y6F1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PARP3Q9Y6F1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PARP3Q9Y6F1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PARP3Q9Y6F1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PARP3Q9Y6F1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PARP3Q9Y6F1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PARP3Q9Y6F1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PARP3Q9Y6F1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PARP3Q9Y6F1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PARP3Q9Y6F1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PARP3Q9Y6F1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PARP3Q9Y6F1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PARP3Q9Y6F1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP3Q9Y6F1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms