Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms