Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHIC2Q9UKJ5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms