Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MIS18AQ9NYP9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
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