Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EMILIN3Q9NT22 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms