Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDHAF3Q9NRP4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms