Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms