Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms