Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms