Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIRT1Q96EB6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms