Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms