Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00116Q8NCU8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LINC00116Q8NCU8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LINC00116Q8NCU8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LINC00116Q8NCU8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LINC00116Q8NCU8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
LINC00116Q8NCU8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LINC00116Q8NCU8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00116Q8NCU8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00116Q8NCU8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00116Q8NCU8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00116Q8NCU8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00116Q8NCU8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00116Q8NCU8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00116Q8NCU8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00116Q8NCU8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00116Q8NCU8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms