Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC191Q8NCU4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms