Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms