Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms