Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC4Q8N9L1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms