Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC6Q8IVU3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms