Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms