Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTF1AQ7RTS3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTF1AQ7RTS3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms