Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC144NLQ6NUI1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms