Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECM29Q5VYK3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms