Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PERM1Q5SV97 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms