Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP188Q5SRE5 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP188Q5SRE5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms